Doctor Who จะดำเนินเรื่องเกี่ยวกับตัวละครหลักของเรื่องซึ่งเป็นไทม์ลอร์ดจากดาวกัลลิเฟรย์ ที่มีชื่อว่า ''เดอะ ดอกเตอร์'' เขาหลบหนีมาจากกัลลิเฟรย์โดยขโมย ทาร์ดิส(ย่อมาจาก: Time and Relative Dimensions in Space) ซึ่งเป็นไทม์แม็คชีนที่สามารถพาเขาไปที่ไหนก็ได้ในห้วงเวลาและอวกาศ ทาร์ดิสจะมี ''วงจรกิ้งก่า'' โดยปกติแล้วจะทำให้ยานนี้เมื่อลงจอดที่ไหนก็ตาม มันก็จะเปลี่ยนรูปลักษณ์ภายนอกให้กลบกลืนกับสถานที่นั้น แต่อย่างไรก็ตาม ทาร์ดิสของดอกเตอร์ก็ได้ติดอยู่ในรูปร่างของตู้โทรศัพท์สีน้ำเงินของอังกฤษเนื่องจากความผิดพลาดในวงจรกิ้งก่าดอกเตอร์มีไม่บ่อยครั้งนักที่เขาจะออกเดินทางตัวคนเดียว ส่วนใหญ่เขาจะพาคู่หูไปออกผจญภัยด้วย คู่หูของเขาจะเป็นมนุษย์เสียส่วนใหญ่เนื่องจากเขาพบว่าโลกเป็นดาวที่มีความน่าหลงใหล เขาไปพบเจอกับเหตุการณ์ประหลาดบ่อยครั้งซึ่งเขาก็พยายามที่จะหยุดยั้งเอเลี่ยนชั่วร้ายที่บุกรุกทำร้ายผู้คนหรือพยายามเปลี่ยนแปลงประวัติศาสตร์ โดยใช้เพียงความชาญฉลาดและเครื่องมือของเขา เช่น ไขควงคลื่นเสียง ในเมื่อเขาเป็นไทม์ลอร์ด เขาก็มีความสามารถที่จะ รีเจเนอเรท เมื่อร่างกายของเขานั้นบาดเจ็บ จึงส่งผลให้รูปลักษณ์ภายนอกและลักษณะนิสัยเปลี่ยนไปด้วย ดอกเตอร์ได้ก่อศัตรูขึ้นมามากมายในขณะที่เขาออกเดินทางอยู่รวมถึง ดาเล้คส์ , ไซเบอร์แมน และ เดอะ มาสเตอร์ ซึ่งเป็นไทม์ลอร์ดเหมือนกับเขาอีกด้วย